Le département de saône et Loire se découpe en 11 petites régions agricoles : le Morvan, l'Autunois, la Sologne Bourbonnaise, le Brionnais, le Charolais, le Clunysois, la Côte Chalonnaise, le Mâconnais, la Bresse Chalonnaise et le Chalonnais, la Bresse Louhanaise.

Le Morvan, l'Autunois, la Sologne Bourbonnaise, le Charolais, le Brionnais, le Clunysois sont des régions dédiées à l'élevage bovin, avec une surface agricole utile herbagère au moins à 80 %. Ces régions qui constituent la partie ouest du département détiennent la plus grande part du troupeau allaitant charolais.

Des petits cheptels caprins et ovins complètent les élevages bovins viande. La Saône et Loire est le premier producteur de fromages de chèvres fermiers, avec notamment une appellation en cours de demande de reconnaissance en AOC : le Charolais.

Les régions du Mâconnais et du Chalonnais constituent la majeure partie du vignoble de Saône et Loire qui débute à l'extrémité du Beaujolais avec les crus de Chénas, Moulin à Vent, Saint-Amour et Juliènas. En Mâconnais s'épanouissent Saint-Véran, Pouilly-Fuissé, Pouilly-Vinzelles, Pouilly-Loché, Viré-Clessé et toute la gamme des Mâcon Blancs et Rouges. Plus au nord, c'est le territoire des Bourgognes Côte Chalonnaise, des crus de Mercurey, Givry, Rully, Montagny, Bouzeron, côte du Couchois et des Crémants. Hautes Côtes de Beaune et Maranges couvrent l'extrémité nord du département.

Les cépages sont le Gamay et le Pinot Noir pour les vins rouges ; le Chardonnay et l'Aligoté pour les vins blancs.

Des troupeaux caprins se trouvent çà et là en zone viticole, avec la production d'un deuxième fromage fermier, le Mâconnais, reconnu en AOC depuis décembre 2006.

L'est du département, Bresse et Chalonnais, est une région de polyculture et élevage.

Les grandes cultures en Saône et Loire se situent essentiellement en Chalonnais et en Bresse Chalonnaise. Les bassins de Louhans et de Chalon sont réputés pour leurs productions de légumes et de fleurs avec une spécialité : le chrysanthème.

Les exploitations laitières se trouvent majoritairement à l'est et la Bresse Louhannaise se caractérise par une production de porc très concentrée.
La Bresse est enfin particulièrement réputée pour ses volailles. L'AOC "Volaille de Bresse" (poulets, chapons et poulardes) et l'AOC "Dinde de Bresse" font la gloire de toute la région.